히라기 나지카는 대형 제약회사 산하에서 부분독립한 회사조직 CRI의 향수 제조사이다. 그녀가 만든 향수 중 몇몇 작품은 큰 인기를 얻어 세계적으로도 유명하다. 실적을 인정받아 회사에서 전용 연구실도 할당받고, 4LDK의 넓은 맨션에서 혼자만의 생활을 만끽하고 있다.
허나 나지카에겐 또 다른 일면이 있다. 그것은 어느 비밀 조사조직의 톱에이전트로서의 일면이다. 나지카는 언제나 단독으로 수많은 임무를 해냈다. 완벽하고 빈틈없는 나지카의 스타일에서는 오히려 그러한 위험을 즐기는 것처럼 보일 정도다.
그런 나지카는 어느 날 조직이 보낸 휴마리트(=인조인간) '리라'를 만나게 되었다. 조직의 명령에 따라 리라와 강제로 파트너가 된 나지카. 인간을 뛰어넘은 경이로운 능력을 묵묵히 펼치면서도 이해할 수 없는 행동을 보이는 리라. 나지카는 그런 리라에게 휘둘리면서도 임무를 수행해나간다.